Râurile Estoniei sunt foarte mici și printre cele șapte sute de râuri ale țării, doar nouă se pot lăuda cu depășirea mărcii de o sută de kilometri.
Râul Piusa
Piusa trece prin teritoriile a două state - Republica Estonia și Rusia. Lungimea totală a albiei râului este de nouăzeci și trei de kilometri. Diviziunea este următoarea: Estonia deține optzeci de kilometri de Piusa; ponderea teritoriului rus a reprezentat o treisprezece kilometri mici. Suprafața totală a bazinului este de 796 de kilometri pătrați.
Sursa râului este situată pe terenurile estoniene în apele lacului Alasjärv (satul Villa, situat în direcția sud-vest de satul Vastseliina - doisprezece kilometri). Gura râului este o oglindă a lacului Peipsi, nu departe de satul Budovizh. La confluență, Piusu se împarte, curgând în lac în două ramuri.
Cursul de mijloc al râului - optsprezece kilometri între satele Vastseliina și Saetamme - se întinde de-a lungul unei frumoase scobituri. Ea a devenit locul unde a fost organizată rezervația. A fost fondată în 1965 și acoperă o suprafață cu o suprafață totală de peste nouă kilometri pătrați.
Râul Võhandu
Võhandu este cea mai lungă cale navigabilă din republică. Lungimea sa totală este egală cu o sută șaizeci și doi de kilometri. Sursa Võhandu este situată în apropierea așezării estoniene Saverna. După aceea, tranzitează prin adâncurile lacului Jiksi și finalizează călătoria, conectându-se la apele lacului cald. Acest lucru se întâmplă nu departe de satul Võõpsu.
Este de remarcat faptul că, înainte de Lacul Vagula, locuitorii numesc acest râu Pyhajõgi, dar după ieșirea sa din apele sale - Voo.
Navele navighează de-a lungul râului de-a lungul secțiunii delimitate de lacul Peipsi și de portul situat pe teritoriul satului Võõpsu. Numeroase fluxuri sunt principalii furnizori de apă către Võhandu.
Râul Parnu
Pärnu este un râu eston cu o lungime totală de o sută patruzeci și patru de kilometri. Suprafața totală a bazinului este de aproape șapte kilometri pătrați. Sursa râului este un lac miniatural cu origine izvorărească (nu departe de Roosno-Alliku), dar încheie ruta Pärnu, curgând în apele golfului Pärnus (o parte a Golfului Riga, zona de apă baltică).
Râul este hrănit amestecat. Și dacă în zonele superioare, apele subterane devin furnizori, atunci în zonele inferioare sunt ploi. Râul nu îngheață întotdeauna iarna. Dacă se întâmplă acest lucru, atunci se formează gheață din aproximativ a doua decadă a lunii decembrie și durează până la sfârșitul lunii martie.
Râul este navigabil numai lângă locul confluenței sale. Albia râului este blocată de baraje în unsprezece locuri.